549پ

Study Of Phylogenetic Relationship Among Wild Almond Species Of Iran Using Sequences Of ITS1-5.8S rDNA-ITS2 And Choloroplast trnL

كارشناسي ارشد

بيوتكنولوژي كشاورزي

دانشگاه پيام نور تهران شرق

1393

1393/2/31

عالي

101ص.

شيران ، بهروز

روحي ، وحيد - ابراهيمي ، محمد علي

85-92

Prunus species, ITS1-5.8S rDNA-ITS2 , trnL chloroplast, phylogeny

رابطه فيلوژني بين 82 گونه وحشي Prunus ، يك رقم زراعي بادام و يك رقم هلو، با استفاده از توالي هاي ناحيه ITS1-5.8S rDNA-ITS2 ژن ريبوزومي و ناحيه trnL DNA كلروپلاستي مورد ارزيابي قرار گرفت. تواليهاي نوكلئوتيدي حاصل از اين بررسي در بانك ژن NCBI به كمك nucleotide blast مورد شناسايي قرار گرفتند. دادهها توسط برنامه CLUSTAL X همرديف شدند. ميزان تناسب همرديفيها با آناليز فيلوژنيك به كمك روش آناليز نقشهيابي حداكثر درستنمايي ) LMA ( و با به كارگيري نرم افزار TREE-PUZZLE-5.2 براساس آناليز چهار بخشي انجام گرفت. روشهاي حداكثر شباهت و نزديكترين همسايگي به منظور آناليز ماتريس دادههاي حاصل، توسط نرم افزار 4.0 *PAUPbeta استفاده گرديدند. علاوه بر اين، براي بالا بردن دقت يكبار ديگر نيز دادهها با استفاده از نرم افزار Mega مورد بررسي قرار گرفتند. فواصل ژنتيكي براي هرجفت از گونهها مشخص شد و ميانگين فاصلۀ ژنتيكي در بين گونهها تنها كمترين فاصلۀ ژنتيكي را در داخل جنس نشان ميدهد.

1395/6/16

34138